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RNA琼脂糖凝胶试剂配制方法及操作流程
点击次数:5659 更新时间:2014-02-24

材料、试剂及器具
1、 材料
总rna提取物。
2、 试剂
(1)0.1%DEPC水:200ml双蒸去离子水加0.2mlDEPC焦炭酸、二乙酯混匀,室温放置过夜,高压灭菌。
(2)10x电泳缓冲液。
吗啉代丙烷磺酸(MOPS) 0.4mol/L(pH 7.0)
NaAc 0.1mol/L
乙二胺四乙酸(EDTA) 10mmol/L
(3)50mL变性琼脂糖凝胶(1%)
(4)10x电泳缓冲液 5 mL
琼脂糖 0.5 g
0.1%DEPC水 36.5 mL
加热溶解,稍冷却,加入8.5 mL 37%甲醛。
(5)上样缓冲液:50%,1mmmol/LEDTA,0.4% 溴酚兰,0.4%二甲苯蓝。
(6)甲酰胺(去离子)。
3、器具
(1)电泳系统
(2)紫外透视仪
RNA琼脂糖凝胶电泳实验原理、试剂配制方法及操作流程
四、操作步骤
1、 将制胶用具用70%乙醇冲洗一遍,晾干备用。
2、 制胶:
称取0.5g琼脂糖粉末,加入放有36.5mL的DEPC水的锥形瓶中,加热使琼脂糖*溶解。稍冷却后加入5mL的10x电泳缓冲液、8.5mL的甲醛。然后在胶槽中灌制凝胶,插好梳子,水平放置待凝固后使用。
3、 加样:
在一个洁净的小离心管中混合以下试剂:电泳缓冲液(10x)2μl、甲醛3.5mL、甲酰胺10mL、RNA样品3.5μl。混匀,置60℃保温10min,冰上速冷。加入3μl的上样缓冲液混匀,取适量加样于凝胶点样孔内。同时点RNA标准样品。
4、 电泳:
打开电泳仪,稳压7.5V/cm电泳。
5、 电泳结束后通过紫外透视仪观察。
五、注意事项
本实验中必务必要去除RNase污染,防止RNA降解。所有试剂和器具需要用DEPC水配制和处理,并灭菌。此外可通过18s rRNA、28s rRNA、5s rRNA的三条带的亮度判定RNA的完整性。

 
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