理论上讲，理想的基因治疗载体应该*由天然染色体成分组成，至少具备三个结构要素：复制原点、端粒和着丝粒。当其进入靶细胞后，目的基因能够模拟自然条件下基因表达或者作为游离基因而稳定复制，即可控性表达，这是基因治疗成功的关键所在。外源性基因进入靶细胞后，若其表达处于失控状态，将带来严重的后果。的可控性模式是模拟人类基因自然状态下的调控形式，实现这种可控性表达需要目的基因全长或包括上下游的调控区及内含子，这就对载体系统提出了*的要求，它必须具备数十个kb到几百个kb的包装能力，同时还要考虑到重复序列的DNA重排和丢失问题；其次，一个如此长的片段进入细胞内，其整合位点相当重要，zui终理想是能够实现定点插入，或者作为一个游离基因表达。传统的基因治疗载体，如逆转录病毒载体、腺病毒载体等，很难达到以上要求，并且存在免疫异源性、插入诱变等许多问题。
1． HAC的构建策略
人工染色体的构想，为载体研究提供了新的思路。这类载体不需要病毒蛋白质衣壳；能够象天然染色体一样以线状或环状存在；同时，在缺乏选择压力的情况下，能够以较低的拷贝数在细胞内稳定存在；有无限的克隆能力；不但能插入靶基因，还能插入其他的调控元件或特异性细胞靶向元件。基于上述优点，研究者们对其倾注了不懈的努力。1983年，酵母人工染色体构建成功，14年后，*个HAC的成功构建，被认为是基因治疗载体研究领域的重大突破。此后，研究者相继构建了各种不同的HAC。目前，构建HAC基于如下两种策略。
（1） 自上而下的策略 该策略是以天然染色体的断裂片段为基础，构建新的HAC。这些断裂片段主要通过以下方法得到：（a）低剂量辐射;（b）端粒定位染色体截断技术（见图1）;（c）外源性DNA片段定点插入后扩增;（d）天然染色体有丝分裂过程中自发产生的碎片。研究者发现，将外源性端粒dna整合入哺乳动物染色体，可将该染色体截断，同时在断端产生新的端粒。研究者们应用这种技术修剪哺乳动物染色体，成功构建了一系列大小在0.5～6 Mb之间不等HAC。zui初，端粒DNA整合的位点是随机的，而现在，研究者们能够将端粒DNA定点插入染色体中特定的位点。所获得的这些微型染色体在结构上相当稳定。Grimes等